Кроме свободных внеклеточных форм, в организме человека и животных встречаются псевдоцисты (130). Размеры псевдоцист от 30 до 100 мк и более. Псевдоцисты в большом количестве находятся в разных органах во время острой стадии болезни.
При переходе инфекции в хроническую форму токсоплазмы сохраняются в организме в виде цист, окруженных оболочкой. Цисты содержат большое количество токсоплазм. Размеры цист от 15 до 40 мк, форма их шаровидная, овальная и неправильная.