Лизогенизация бактерий лежит в основе ряда генетических феноменов, в частности лизогенной конверсии.
Лизогенная конверсия заключается в приобретении клетками некоторых свойств в результате лизогенизации. Лизогенизация может изменять морфологию бактерий, обусловливать синтез поверхностных антигенов. У дифтерийных и других микробов установлена связь между лизогенизацией и токсинообразованием.