В настоящее время в практике эпидемиологического обследования широко применяется фаготипирование бактерий метод дифференцирования их внутри вида или серотипа. Этот метод позволяет распознать подлинный источник инфекции и дает возможность проследить иногда очень сложный путь передачи возбудителя от источника до восприимчивого организма. Преимущества метода фаготипирования заключаются в том, что с помощью фагов можно более тонко подразделить возбудителей инфекционных заболеваний, чем это делали с помощью биохимических, биологических или даже серологических тестов.