В первые минуты после проникновения ДНК внутрь бактериальной клетки в течение скрытого периода фаговые частицы обнаружить не удается. Однако в клетке развиваются процессы, индуцированные проникшим внутрь нее фаговым геномом. В этот период в индуцированной фагом бактериальной клетке начинаются синтезы фаговой информационной РНК (m РНК), внутреннего белка фага, а затем так называемых ранних белков фага, которые не включаются в структуру фаговой частицы, а участвуют в ряде сложных биохимических реакций, связанных с биосинтезом фаговой ДНК. ДНК фага начинает обнаруживаться в клетке через 8 9 минут. В это время начинают формироваться и структурные белки, в числе которых накапливается и фаговый лизоцим, обусловливающий литическую активность большинства бактериальных вирусов. К 12 й минуте синтез ранних белков прекращается, в то время как синтез ДНК и структурных белков фага продолжается с высокой скоростью до конца латентного периода.