Кроме выделения вируса и серологических реакций, для диагностики гриппа применяют методы иммунофлюоресценции. Для этого готовят мазки из секретов носоглотки или конъюнктивы, препараты обрабатывают флюоресцирующими типоспецифическими сыворотками по методу Кунса и просматривают в люминесцентном микроскопе. В местах соединения вируса со специфическими антителами наблюдается яркая светящаяся зона отложившегося флюорохрома. С помощью этого метода удается не только обнаружить наличие вируса в пораженных клетках, но и определить его тип.