Возбудитель криптококкоза (Cryptococcus neoformans) (Сан Фелицс, 1894) относится к семейству Arthrospores, роду Cryptococcus. В патологическом материале имеет вид круглых и овальных дрожжеподобных клеток с одной почкой, окруженных широкой желатинообразной капсулой, отчетливо видимой при специальных методах окраски. Морфология гриба в культуре мало чем отличается от морфологии тканевых форм. В протоплазме гриба много зерен, имеющих сходство с эндоспорами, мелких вакуолей.